Я думаю, что корень "чуд". Суффикс "ищ" показывает увеличение. Можно сказать и "чудище" (морское). Интересно, что в немецком языке есть уменьшительный суффикс "chen" , но нет увеличительного. Суффикс "ищ" встречается также в словах "жилище, дружище, кладбище, пожарище, товарищ", но в каждом из этих слов его действие различно.
